До перемотки генератора АКБ не садился?
1.Если нет ,то скорей всего косяк в этом (Вторую неделю сервис с ремонтниками генератора рамсят(он на гарантии после перемотки))
2.При сборке могли что нибудь (коротнуть ,сломать ,забыть поставить или не на своё место поставить какой нибудь изолятор )
3.Ещё у меня один раз было на TOYOTA сгорел один диод в диодном мосту заряд шёл но через раз и АКБ садился,я тогда даже новый АКБ поставил. Пока сам не разобрал генератор и внимательно осмотрел его и прозвонил.
4.Взять у кого нибудь с исправной машины генератор ,поставить вместо своего и проверить на утечку.